Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKN1Q16512 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKN1Q16512 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKN1Q16512 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
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