Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SSX1Q16384 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSX1Q16384 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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