Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PRR4Q16378 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PRR4Q16378 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PRR4Q16378 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PRR4Q16378 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PRR4Q16378 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PRR4Q16378 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms