Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USF2Q15853 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USF2Q15853 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USF2Q15853 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USF2Q15853 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USF2Q15853 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USF2Q15853 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USF2Q15853 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USF2Q15853 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USF2Q15853 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USF2Q15853 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USF2Q15853 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USF2Q15853 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USF2Q15853 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USF2Q15853 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
USF2Q15853 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USF2Q15853 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USF2Q15853 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USF2Q15853 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USF2Q15853 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USF2Q15853 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USF2Q15853 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USF2Q15853 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USF2Q15853 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USF2Q15853 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USF2Q15853 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
USF2Q15853 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USF2Q15853 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USF2Q15853 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USF2Q15853 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USF2Q15853 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USF2Q15853 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USF2Q15853 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
USF2Q15853 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
USF2Q15853 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
USF2Q15853 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
USF2Q15853 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
USF2Q15853 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
USF2Q15853 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
USF2Q15853 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
USF2Q15853 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
USF2Q15853 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
USF2Q15853 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
USF2Q15853 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
USF2Q15853 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
USF2Q15853 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
USF2Q15853 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
USF2Q15853 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
USF2Q15853 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
USF2Q15853 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
USF2Q15853 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
USF2Q15853 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
USF2Q15853 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
USF2Q15853 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
USF2Q15853 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
USF2Q15853 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
USF2Q15853 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
USF2Q15853 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
USF2Q15853 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
USF2Q15853 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
USF2Q15853 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
USF2Q15853 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
USF2Q15853 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
USF2Q15853 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
USF2Q15853 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
USF2Q15853 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
USF2Q15853 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
USF2Q15853 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
USF2Q15853 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
USF2Q15853 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
USF2Q15853 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
USF2Q15853 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
USF2Q15853 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
USF2Q15853 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
USF2Q15853 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USF2Q15853 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USF2Q15853 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USF2Q15853 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USF2Q15853 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USF2Q15853 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USF2Q15853 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USF2Q15853 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USF2Q15853 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USF2Q15853 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USF2Q15853 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USF2Q15853 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USF2Q15853 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USF2Q15853 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USF2Q15853 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USF2Q15853 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USF2Q15853 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USF2Q15853 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USF2Q15853 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USF2Q15853 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USF2Q15853 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USF2Q15853 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
USF2Q15853 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USF2Q15853 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USF2Q15853 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
USF2Q15853 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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