Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITSN1Q15811 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITSN1Q15811 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITSN1Q15811 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITSN1Q15811 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITSN1Q15811 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITSN1Q15811 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITSN1Q15811 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITSN1Q15811 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITSN1Q15811 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITSN1Q15811 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITSN1Q15811 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITSN1Q15811 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITSN1Q15811 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ITSN1Q15811 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ITSN1Q15811 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
ITSN1Q15811 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ITSN1Q15811 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ITSN1Q15811 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
ITSN1Q15811 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ITSN1Q15811 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
ITSN1Q15811 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ITSN1Q15811 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ITSN1Q15811 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ITSN1Q15811 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ITSN1Q15811 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ITSN1Q15811 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ITSN1Q15811 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ITSN1Q15811 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
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