Protein–RNA interactions for Protein: Q15782

CHI3L2, Chitinase-3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L2Q15782 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CHI3L2Q15782 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHI3L2Q15782 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHI3L2Q15782 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHI3L2Q15782 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHI3L2Q15782 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHI3L2Q15782 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHI3L2Q15782 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHI3L2Q15782 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHI3L2Q15782 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHI3L2Q15782 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHI3L2Q15782 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHI3L2Q15782 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHI3L2Q15782 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHI3L2Q15782 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHI3L2Q15782 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHI3L2Q15782 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHI3L2Q15782 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHI3L2Q15782 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHI3L2Q15782 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHI3L2Q15782 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHI3L2Q15782 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHI3L2Q15782 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHI3L2Q15782 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHI3L2Q15782 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHI3L2Q15782 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHI3L2Q15782 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHI3L2Q15782 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHI3L2Q15782 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHI3L2Q15782 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHI3L2Q15782 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHI3L2Q15782 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHI3L2Q15782 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHI3L2Q15782 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHI3L2Q15782 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms