Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNHIT3Q15649 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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