Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIX1Q15475 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SIX1Q15475 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX1Q15475 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
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