Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RABEP1Q15276 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RABEP1Q15276 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RABEP1Q15276 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RABEP1Q15276 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RABEP1Q15276 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RABEP1Q15276 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RABEP1Q15276 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RABEP1Q15276 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RABEP1Q15276 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RABEP1Q15276 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RABEP1Q15276 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RABEP1Q15276 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RABEP1Q15276 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RABEP1Q15276 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RABEP1Q15276 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RABEP1Q15276 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RABEP1Q15276 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RABEP1Q15276 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RABEP1Q15276 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RABEP1Q15276 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RABEP1Q15276 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
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