Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCLAFQ15004 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PCLAFQ15004 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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