Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB39AQ14964 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB39AQ14964 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB39AQ14964 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB39AQ14964 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB39AQ14964 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB39AQ14964 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB39AQ14964 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAB39AQ14964 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAB39AQ14964 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAB39AQ14964 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAB39AQ14964 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAB39AQ14964 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB39AQ14964 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB39AQ14964 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB39AQ14964 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB39AQ14964 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB39AQ14964 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB39AQ14964 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB39AQ14964 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB39AQ14964 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB39AQ14964 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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RAB39AQ14964 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB39AQ14964 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB39AQ14964 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB39AQ14964 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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RAB39AQ14964 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
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RAB39AQ14964 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB39AQ14964 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB39AQ14964 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB39AQ14964 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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RAB39AQ14964 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB39AQ14964 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB39AQ14964 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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RAB39AQ14964 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB39AQ14964 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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RAB39AQ14964 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB39AQ14964 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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RAB39AQ14964 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB39AQ14964 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB39AQ14964 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB39AQ14964 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB39AQ14964 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB39AQ14964 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB39AQ14964 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB39AQ14964 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB39AQ14964 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB39AQ14964 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB39AQ14964 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB39AQ14964 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB39AQ14964 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB39AQ14964 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB39AQ14964 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB39AQ14964 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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