Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NFIXQ14938 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFIXQ14938 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
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