Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN5AQ14524 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCN5AQ14524 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
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