Protein–RNA interactions for Protein: Q14141

SEPT6, Septin-6, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT6Q14141 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEPT6Q14141 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEPT6Q14141 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEPT6Q14141 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SEPT6Q14141 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEPT6Q14141 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEPT6Q14141 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEPT6Q14141 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SEPT6Q14141 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEPT6Q14141 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEPT6Q14141 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEPT6Q14141 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEPT6Q14141 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEPT6Q14141 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEPT6Q14141 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEPT6Q14141 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEPT6Q14141 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEPT6Q14141 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms