Protein–RNA interactions for Protein: Q14114

LRP8, Low-density lipoprotein receptor-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP8Q14114 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRP8Q14114 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP8Q14114 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP8Q14114 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP8Q14114 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP8Q14114 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP8Q14114 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP8Q14114 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP8Q14114 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP8Q14114 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP8Q14114 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP8Q14114 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP8Q14114 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP8Q14114 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP8Q14114 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRP8Q14114 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP8Q14114 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP8Q14114 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP8Q14114 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP8Q14114 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP8Q14114 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP8Q14114 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP8Q14114 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRP8Q14114 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRP8Q14114 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms