Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PDE6HQ13956 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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PDE6HQ13956 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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PDE6HQ13956 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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PDE6HQ13956 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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PDE6HQ13956 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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PDE6HQ13956 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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PDE6HQ13956 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PDE6HQ13956 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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