Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DDX39BQ13838 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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DDX39BQ13838 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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DDX39BQ13838 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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DDX39BQ13838 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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DDX39BQ13838 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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DDX39BQ13838 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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DDX39BQ13838 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
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DDX39BQ13838 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DDX39BQ13838 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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