Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRQ13535 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRQ13535 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRQ13535 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRQ13535 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRQ13535 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRQ13535 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRQ13535 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRQ13535 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRQ13535 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRQ13535 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRQ13535 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRQ13535 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRQ13535 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRQ13535 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRQ13535 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRQ13535 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRQ13535 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRQ13535 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRQ13535 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRQ13535 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRQ13535 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRQ13535 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRQ13535 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRQ13535 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRQ13535 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRQ13535 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRQ13535 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRQ13535 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRQ13535 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRQ13535 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRQ13535 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRQ13535 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRQ13535 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRQ13535 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRQ13535 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRQ13535 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRQ13535 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRQ13535 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRQ13535 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRQ13535 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRQ13535 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRQ13535 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRQ13535 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRQ13535 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRQ13535 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRQ13535 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRQ13535 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRQ13535 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRQ13535 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRQ13535 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRQ13535 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRQ13535 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRQ13535 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRQ13535 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRQ13535 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRQ13535 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRQ13535 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRQ13535 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRQ13535 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRQ13535 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRQ13535 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRQ13535 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRQ13535 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRQ13535 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRQ13535 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRQ13535 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRQ13535 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRQ13535 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRQ13535 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRQ13535 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRQ13535 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRQ13535 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRQ13535 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRQ13535 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRQ13535 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRQ13535 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRQ13535 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRQ13535 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRQ13535 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATRQ13535 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATRQ13535 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATRQ13535 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATRQ13535 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATRQ13535 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATRQ13535 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATRQ13535 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATRQ13535 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATRQ13535 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATRQ13535 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATRQ13535 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATRQ13535 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATRQ13535 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRQ13535 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRQ13535 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRQ13535 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRQ13535 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRQ13535 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRQ13535 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATRQ13535 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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