Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NR5A1Q13285 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NR5A1Q13285 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms