Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC36.18■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC36.15■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
GRIN2BQ13224 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC36.12■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
GRIN2BQ13224 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC36.06■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
GRIN2BQ13224 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
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