Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3BQ13214 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3BQ13214 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
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