Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TRDNQ13061 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRDNQ13061 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
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