Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFSWAPQ12872 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFSWAPQ12872 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFSWAPQ12872 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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