Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BPTFQ12830 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BPTFQ12830 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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