Protein–RNA interactions for Protein: Q12765

SCRN1, Secernin-1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN1Q12765 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCRN1Q12765 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCRN1Q12765 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCRN1Q12765 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCRN1Q12765 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SCRN1Q12765 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCRN1Q12765 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCRN1Q12765 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCRN1Q12765 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCRN1Q12765 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCRN1Q12765 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCRN1Q12765 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCRN1Q12765 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCRN1Q12765 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCRN1Q12765 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCRN1Q12765 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCRN1Q12765 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCRN1Q12765 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCRN1Q12765 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCRN1Q12765 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCRN1Q12765 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCRN1Q12765 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCRN1Q12765 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SCRN1Q12765 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCRN1Q12765 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SCRN1Q12765 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCRN1Q12765 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCRN1Q12765 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCRN1Q12765 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCRN1Q12765 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCRN1Q12765 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCRN1Q12765 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCRN1Q12765 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCRN1Q12765 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCRN1Q12765 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCRN1Q12765 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms