Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOBRQ0VD83 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
APOBRQ0VD83 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOBRQ0VD83 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms