Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCBP1Q09161 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms