Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSRP1Q08945 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SSRP1Q08945 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SSRP1Q08945 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms