Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DSC1Q08554 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSC1Q08554 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSC1Q08554 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms