Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DHX9Q08211 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DHX9Q08211 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.2 ms