Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
ATP7AQ04656 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ATP7AQ04656 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ATP7AQ04656 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms