Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 C1orf132-204ENST00000637970 1170 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNB1Q02641 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNB1Q02641 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms