Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CYP27A1Q02318 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP27A1Q02318 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms