Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SPIBQ01892 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPIBQ01892 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms