Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DEFA5Q01523 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA5Q01523 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA5Q01523 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA5Q01523 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA5Q01523 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA5Q01523 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA5Q01523 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA5Q01523 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA5Q01523 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA5Q01523 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA5Q01523 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DEFA5Q01523 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA5Q01523 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA5Q01523 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA5Q01523 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA5Q01523 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA5Q01523 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA5Q01523 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA5Q01523 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA5Q01523 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA5Q01523 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA5Q01523 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA5Q01523 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA5Q01523 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA5Q01523 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DEFA5Q01523 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEFA5Q01523 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEFA5Q01523 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEFA5Q01523 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEFA5Q01523 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEFA5Q01523 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DEFA5Q01523 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms