Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDK3Q00526 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDK3Q00526 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms