Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HDLBPQ00341 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDLBPQ00341 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms