Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX1P83916 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX1P83916 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX1P83916 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX1P83916 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX1P83916 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX1P83916 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX1P83916 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX1P83916 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX1P83916 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX1P83916 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX1P83916 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX1P83916 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX1P83916 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX1P83916 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX1P83916 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX1P83916 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX1P83916 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX1P83916 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX1P83916 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX1P83916 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX1P83916 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX1P83916 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX1P83916 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX1P83916 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX1P83916 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX1P83916 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX1P83916 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX1P83916 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX1P83916 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX1P83916 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX1P83916 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX1P83916 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX1P83916 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX1P83916 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX1P83916 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX1P83916 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX1P83916 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX1P83916 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX1P83916 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX1P83916 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX1P83916 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX1P83916 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX1P83916 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX1P83916 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX1P83916 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX1P83916 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX1P83916 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX1P83916 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX1P83916 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX1P83916 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX1P83916 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX1P83916 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX1P83916 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX1P83916 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX1P83916 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX1P83916 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX1P83916 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX1P83916 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX1P83916 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX1P83916 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX1P83916 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX1P83916 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX1P83916 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX1P83916 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX1P83916 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX1P83916 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX1P83916 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX1P83916 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX1P83916 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX1P83916 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX1P83916 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX1P83916 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX1P83916 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX1P83916 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX1P83916 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX1P83916 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX1P83916 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX1P83916 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX1P83916 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX1P83916 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX1P83916 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX1P83916 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX1P83916 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX1P83916 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX1P83916 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX1P83916 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX1P83916 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX1P83916 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX1P83916 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX1P83916 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX1P83916 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX1P83916 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX1P83916 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX1P83916 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX1P83916 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX1P83916 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX1P83916 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX1P83916 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX1P83916 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms