Protein–RNA interactions for Protein: P62750

RPL23A, 60S ribosomal protein L23a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP62750 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL23AP62750 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL23AP62750 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms