Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms