Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHB1P54762 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB1P54762 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms