Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PGGT1BP53609 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGGT1BP53609 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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