Protein–RNA interactions for Protein: P52306

RAP1GDS1, Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GDS1P52306 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAP1GDS1P52306 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAP1GDS1P52306 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAP1GDS1P52306 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAP1GDS1P52306 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAP1GDS1P52306 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAP1GDS1P52306 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms