Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB28P51157 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB28P51157 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB28P51157 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB28P51157 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB28P51157 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB28P51157 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB28P51157 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB28P51157 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB28P51157 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB28P51157 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB28P51157 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB28P51157 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB28P51157 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB28P51157 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB28P51157 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB28P51157 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB28P51157 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB28P51157 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB28P51157 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB28P51157 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB28P51157 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB28P51157 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB28P51157 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB28P51157 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB28P51157 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB28P51157 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB28P51157 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB28P51157 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB28P51157 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB28P51157 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB28P51157 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB28P51157 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB28P51157 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB28P51157 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB28P51157 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB28P51157 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB28P51157 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB28P51157 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB28P51157 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB28P51157 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB28P51157 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB28P51157 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RAB28P51157 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RAB28P51157 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB28P51157 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB28P51157 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB28P51157 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB28P51157 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB28P51157 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB28P51157 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB28P51157 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB28P51157 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB28P51157 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB28P51157 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB28P51157 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB28P51157 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB28P51157 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB28P51157 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB28P51157 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB28P51157 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB28P51157 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB28P51157 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB28P51157 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RAB28P51157 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB28P51157 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB28P51157 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB28P51157 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB28P51157 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB28P51157 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB28P51157 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB28P51157 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB28P51157 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB28P51157 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB28P51157 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB28P51157 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB28P51157 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB28P51157 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB28P51157 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB28P51157 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB28P51157 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB28P51157 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB28P51157 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB28P51157 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB28P51157 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB28P51157 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB28P51157 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB28P51157 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB28P51157 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB28P51157 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB28P51157 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB28P51157 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB28P51157 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB28P51157 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB28P51157 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB28P51157 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB28P51157 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB28P51157 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB28P51157 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB28P51157 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms