Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP1A2P50993 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP1A2P50993 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms