Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCP4P48539 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCP4P48539 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCP4P48539 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCP4P48539 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCP4P48539 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCP4P48539 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCP4P48539 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCP4P48539 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCP4P48539 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCP4P48539 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCP4P48539 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCP4P48539 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCP4P48539 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCP4P48539 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCP4P48539 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCP4P48539 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCP4P48539 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCP4P48539 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCP4P48539 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCP4P48539 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCP4P48539 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCP4P48539 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCP4P48539 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCP4P48539 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCP4P48539 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCP4P48539 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCP4P48539 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCP4P48539 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCP4P48539 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCP4P48539 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCP4P48539 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCP4P48539 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCP4P48539 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCP4P48539 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCP4P48539 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCP4P48539 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCP4P48539 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCP4P48539 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCP4P48539 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCP4P48539 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCP4P48539 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCP4P48539 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCP4P48539 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCP4P48539 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCP4P48539 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCP4P48539 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCP4P48539 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCP4P48539 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCP4P48539 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCP4P48539 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCP4P48539 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCP4P48539 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCP4P48539 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PCP4P48539 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCP4P48539 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCP4P48539 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCP4P48539 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCP4P48539 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCP4P48539 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCP4P48539 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PCP4P48539 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCP4P48539 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCP4P48539 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCP4P48539 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCP4P48539 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCP4P48539 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCP4P48539 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCP4P48539 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCP4P48539 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCP4P48539 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCP4P48539 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCP4P48539 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCP4P48539 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCP4P48539 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCP4P48539 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCP4P48539 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCP4P48539 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCP4P48539 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCP4P48539 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
PCP4P48539 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCP4P48539 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCP4P48539 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCP4P48539 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCP4P48539 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCP4P48539 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCP4P48539 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCP4P48539 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCP4P48539 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCP4P48539 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCP4P48539 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCP4P48539 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCP4P48539 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCP4P48539 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCP4P48539 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCP4P48539 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCP4P48539 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCP4P48539 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCP4P48539 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCP4P48539 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms