Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSSP48449 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSSP48449 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSSP48449 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSSP48449 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSSP48449 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LSSP48449 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LSSP48449 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LSSP48449 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSSP48449 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSSP48449 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSSP48449 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSSP48449 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSSP48449 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSSP48449 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSSP48449 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSSP48449 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSSP48449 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSSP48449 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSSP48449 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSSP48449 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSSP48449 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSSP48449 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSSP48449 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSSP48449 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LSSP48449 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSSP48449 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSSP48449 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LSSP48449 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSSP48449 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSSP48449 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSSP48449 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSSP48449 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LSSP48449 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSSP48449 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSSP48449 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSSP48449 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSSP48449 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSSP48449 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSSP48449 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSSP48449 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSSP48449 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LSSP48449 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSSP48449 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSSP48449 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSSP48449 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSSP48449 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSSP48449 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSSP48449 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSSP48449 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LSSP48449 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSSP48449 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSSP48449 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSSP48449 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSSP48449 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LSSP48449 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSSP48449 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSSP48449 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSSP48449 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LSSP48449 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSSP48449 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSSP48449 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSSP48449 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LSSP48449 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSSP48449 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSSP48449 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSSP48449 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSSP48449 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LSSP48449 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSSP48449 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSSP48449 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSSP48449 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSSP48449 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSSP48449 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSSP48449 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LSSP48449 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSSP48449 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSSP48449 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSSP48449 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSSP48449 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LSSP48449 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSSP48449 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSSP48449 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSSP48449 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSSP48449 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSSP48449 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSSP48449 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSSP48449 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSSP48449 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LSSP48449 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSSP48449 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSSP48449 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSSP48449 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSSP48449 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSSP48449 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSSP48449 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSSP48449 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSSP48449 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSSP48449 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LSSP48449 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms