Protein–RNA interactions for Protein: P46776

RPL27A, 60S ribosomal protein L27a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL27AP46776 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL27AP46776 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL27AP46776 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms