Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIA2P42262 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA2P42262 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms