Protein–RNA interactions for Protein: P37020

GEF1, Anion/proton exchange transporter GEF1, yeastyeast

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GEF1P37020 RPS25AYGR027C 327 nt6□□□□□ -1.45
GEF1P37020 FOL2YGR267C 732 nt6□□□□□ -1.45
GEF1P37020 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt6□□□□□ -1.45
GEF1P37020 YJL147CYJL147C 1149 nt6□□□□□ -1.45
GEF1P37020 MST28YAR033W 705 nt6□□□□□ -1.45
GEF1P37020 MAP1YLR244C 1164 nt6□□□□□ -1.45
GEF1P37020 YLR379WYLR379W 375 nt6□□□□□ -1.45
GEF1P37020 GAL10YBR019C 2100 nt6□□□□□ -1.45
GEF1P37020 CUE3YGL110C 1875 nt6□□□□□ -1.45
GEF1P37020 NTH1YDR001C 2256 nt6□□□□□ -1.45
GEF1P37020 PTK2YJR059W 2457 nt6□□□□□ -1.45
GEF1P37020 CUE2YKL090W 1332 nt5.99□□□□□ -1.45
GEF1P37020 SER33YIL074C 1410 nt5.99□□□□□ -1.45
GEF1P37020 SWC3YAL011W 1878 nt5.99□□□□□ -1.45
GEF1P37020 MCX1YBR227C 1563 nt5.99□□□□□ -1.45
GEF1P37020 PRS5YOL061W 1491 nt5.99□□□□□ -1.45
GEF1P37020 RVB1YDR190C 1392 nt5.99□□□□□ -1.45
GEF1P37020 BTT1YDR252W 450 nt5.99□□□□□ -1.45
GEF1P37020 BNA1YJR025C 534 nt5.99□□□□□ -1.45
GEF1P37020 RFU1YLR073C 603 nt5.99□□□□□ -1.45
GEF1P37020 FOL3YMR113W 1284 nt5.99□□□□□ -1.45
GEF1P37020 SCW10YMR305C 1170 nt5.99□□□□□ -1.45
GEF1P37020 YNL019CYNL019C 855 nt5.99□□□□□ -1.45
GEF1P37020 YNL033WYNL033W 855 nt5.99□□□□□ -1.45
GEF1P37020 TPM1YNL079C 600 nt5.99□□□□□ -1.45
GEF1P37020 YNL296WYNL296W 315 nt5.99□□□□□ -1.45
GEF1P37020 MCM16YPR046W 546 nt5.99□□□□□ -1.45
GEF1P37020 TOM5YPR133W-A 153 nt5.99□□□□□ -1.45
GEF1P37020 YPR177CYPR177C 372 nt5.99□□□□□ -1.45
GEF1P37020 MTC5YDR128W 3447 nt5.99□□□□□ -1.45
GEF1P37020 ENP2YGR145W 2124 nt5.99□□□□□ -1.45
GEF1P37020 CDC37YDR168W 1521 nt5.99□□□□□ -1.45
GEF1P37020 ADE4YMR300C 1533 nt5.99□□□□□ -1.45
GEF1P37020 BUD6YLR319C 2367 nt5.99□□□□□ -1.45
GEF1P37020 ACC1YNR016C 6702 nt5.99□□□□□ -1.45
GEF1P37020 YND1YER005W 1893 nt5.98□□□□□ -1.45
GEF1P37020 TUB2YFL037W 1374 nt5.98□□□□□ -1.45
GEF1P37020 OCA6YDR067C 675 nt5.98□□□□□ -1.45
GEF1P37020 BSC2YDR275W 708 nt5.98□□□□□ -1.45
GEF1P37020 RNA15YGL044C 891 nt5.98□□□□□ -1.45
GEF1P37020 ACP1YKL192C 378 nt5.98□□□□□ -1.45
GEF1P37020 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt5.98□□□□□ -1.45
GEF1P37020 IZH2YOL002C 954 nt5.98□□□□□ -1.45
GEF1P37020 CYK3YDL117W 2658 nt5.98□□□□□ -1.45
GEF1P37020 COG2YGR120C 789 nt5.97□□□□□ -1.45
GEF1P37020 YIL161WYIL161W 708 nt5.97□□□□□ -1.45
GEF1P37020 PET130YJL023C 1044 nt5.97□□□□□ -1.45
GEF1P37020 HPA2YPR193C 471 nt5.97□□□□□ -1.45
GEF1P37020 YBR096WYBR096W 693 nt5.97□□□□□ -1.45
GEF1P37020 ADE6YGR061C 4077 nt5.97□□□□□ -1.45
GEF1P37020 HAP1YLR256W 4509 nt5.97□□□□□ -1.45
GEF1P37020 ESC8YOL017W 2145 nt5.96□□□□□ -1.45
GEF1P37020 HPF1YOL155C 2904 nt5.96□□□□□ -1.45
GEF1P37020 THI7YLR237W 1797 nt5.96□□□□□ -1.46
GEF1P37020 TPD3YAL016W 1908 nt5.96□□□□□ -1.46
GEF1P37020 MSH1YHR120W 2880 nt5.96□□□□□ -1.46
GEF1P37020 NKP1YDR383C 717 nt5.96□□□□□ -1.46
GEF1P37020 CAX4YGR036C 720 nt5.96□□□□□ -1.46
GEF1P37020 SAE3YHR079C-A 276 nt5.96□□□□□ -1.46
GEF1P37020 CAP1YKL007W 807 nt5.96□□□□□ -1.46
GEF1P37020 HMX1YLR205C 954 nt5.96□□□□□ -1.46
GEF1P37020 MPP6YNR024W 561 nt5.96□□□□□ -1.46
GEF1P37020 YNR042WYNR042W 429 nt5.96□□□□□ -1.46
GEF1P37020 PSF3YOL146W 585 nt5.96□□□□□ -1.46
GEF1P37020 YPL199CYPL199C 723 nt5.96□□□□□ -1.46
GEF1P37020 YBR071WYBR071W 636 nt5.96□□□□□ -1.46
GEF1P37020 POL30YBR088C 777 nt5.96□□□□□ -1.46
GEF1P37020 AMA1YGR225W 1782 nt5.95□□□□□ -1.46
GEF1P37020 SRS2YJL092W 3525 nt5.95□□□□□ -1.46
GEF1P37020 GCD2YGR083C 1956 nt5.95□□□□□ -1.46
GEF1P37020 HMO1YDR174W 741 nt5.95□□□□□ -1.46
GEF1P37020 COBQ0105 1158 nt5.95□□□□□ -1.46
GEF1P37020 YER076CYER076C 909 nt5.95□□□□□ -1.46
GEF1P37020 MPO1YGL010W 525 nt5.95□□□□□ -1.46
GEF1P37020 YGR026WYGR026W 837 nt5.95□□□□□ -1.46
GEF1P37020 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt5.95□□□□□ -1.46
GEF1P37020 APQ13YJL075C 417 nt5.95□□□□□ -1.46
GEF1P37020 YMR010WYMR010W 1218 nt5.95□□□□□ -1.46
GEF1P37020 YOR364WYOR364W 369 nt5.95□□□□□ -1.46
GEF1P37020 OPY2YPR075C 1083 nt5.95□□□□□ -1.46
GEF1P37020 CTP1YBR291C 900 nt5.95□□□□□ -1.46
GEF1P37020 OAF1YAL051W 3144 nt5.95□□□□□ -1.46
GEF1P37020 GAL4YPL248C 2646 nt5.95□□□□□ -1.46
GEF1P37020 NMD3YHR170W 1557 nt5.94□□□□□ -1.46
GEF1P37020 DTD1YDL219W 453 nt5.94□□□□□ -1.46
GEF1P37020 KEI1YDR367W 666 nt5.94□□□□□ -1.46
GEF1P37020 YDR491CYDR491C 492 nt5.94□□□□□ -1.46
GEF1P37020 BUD25YER014C-A 462 nt5.94□□□□□ -1.46
GEF1P37020 YER158W-AYER158W-A 216 nt5.94□□□□□ -1.46
GEF1P37020 PPG1YNR032W 1107 nt5.94□□□□□ -1.46
GEF1P37020 GRX7YBR014C 612 nt5.94□□□□□ -1.46
GEF1P37020 RPS11BYBR048W 471 nt5.94□□□□□ -1.46
GEF1P37020 MSS4YDR208W 2340 nt5.94□□□□□ -1.46
GEF1P37020 TRP3YKL211C 1455 nt5.94□□□□□ -1.46
GEF1P37020 RPT4YOR259C 1314 nt5.94□□□□□ -1.46
GEF1P37020 TAF8YML114C 1533 nt5.94□□□□□ -1.46
GEF1P37020 DSL1YNL258C 2265 nt5.94□□□□□ -1.46
GEF1P37020 GEM1YAL048C 1989 nt5.93□□□□□ -1.46
GEF1P37020 MTC7YEL033W 420 nt5.93□□□□□ -1.46
GEF1P37020 RPN12YFR052W 825 nt5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.8 ms